公司扣除绩效工资是否违法，需结合具体情况判断。以下是不同情形下扣除绩效工资的合法性分析：
- 若公司扣除绩效工资无合法依据（如未在劳动合同中约定绩效工资的考核标准、计算方式及扣除条件），则该扣除行为违法。
- 若公司已依法制定并公示明确的绩效管理制度，且制度中对绩效工资的考核标准、计算方式、扣除条件及程序有具体规定，员工在知晓并认可该制度的情况下，公司按制度规定因员工未达考核标准而扣除绩效工资，该行为合法。
- 若公司扣除绩效工资的程序不合理（如未书面告知扣除理由、依据及具体金额，或未给予员工陈述和申辩机会），即便有制度依据，扣除行为也可能因程序违法而不合法。
- 若公司扣除绩效工资是出于惩罚员工、逼迫离职等恶意目的，而非基于员工实际工作表现和绩效制度，无论是否有制度，该扣除行为均违法。
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判断公司扣除绩效工资是否违法时，以下特殊情况或例外情形可能影响处理结果：
1. 绩效管理制度未经民主程序制定或未公示。若公司扣除绩效工资所依据的制度，未经过职工代表大会或全体职工讨论，未与工会或职工代表平等协商确定，且未向劳动者公示或告知，则该制度不能作为合法依据，公司据此扣除绩效工资的行为违法，劳动者有权要求补发。
2. 扣减绩效工资比例过高显失公平。即使公司有合法有效的绩效管理制度，但若扣除的绩效工资金额过高，导致劳动者当月实际收入远低于当地最低工资标准或显著影响基本生活，该扣除行为可能因违反公平原则被认定为不合理，公司需调整扣除比例，保障劳动者基本权益。
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公司扣除绩效工资是否违法，法律上有明确依据。以下结合相关法律法规详细分析：
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”绩效工资作为工资的重要组成部分，公司扣除绩效工资必须符合上述规定，即不得无故克扣。同时，《中华人民共和国劳动合同法》第四条规定，用人单位在制定、修改或决定有关劳动报酬等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，应当经职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定，并应当公示或告知劳动者。若公司扣除绩效工资所依据的规章制度未经过上述民主程序制定、未公示或未告知员工，该扣除行为即违反《劳动合同法》的规定。综上，公司扣除绩效工资若缺乏合法依据或未履行合理程序，即属于违法行为。
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公司扣除绩效工资的行为可能给劳动者带来以下法律风险，需引起重视：
1. 公司可能以“未达考核标准”为由随意扣减绩效工资。若劳动者实际工作表现符合公司常规考核要求，但公司为降低用工成本，单方面提高考核标准或设置不合理考核指标，并以此为由扣除绩效工资，劳动者的合法劳动报酬权益将受侵害。
2. 公司可能在未与劳动者协商一致的情况下，擅自变更绩效工资计算方式并据此扣除绩效工资。例如，公司原本按销售额的5%计算绩效工资，后未经劳动者同意突然将比例降至3%，导致劳动者绩效工资减少，这种行为可能使劳动者面临绩效工资被违法扣除的风险。

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